Cisteamino hidrochloridas gali būti naudojamas gaminant kosmetiką, pašarų priedą, vaistą nuo opų, jis taip pat gali būti naudojamas gaminant biocheminį reagentą ir sudėtingą sunkiųjų mėsos jonų agentą. Jis gali reaguoti su žmogaus kūno fermentu ir stabilizuoti jo savybes, kai yra radiacija, todėl jis gali būti naudojamas gydant radiacijos sindromą ir tetraetilo švino nuodus. Iš jo galima gaminti tabletes arba injekcijas.